Antônio Jussivan Alves dos Santos (Alemão): Apontado como mentor do assalto, foi preso em fevereiro de 2008, no Distrito Federal. Condenado a 49 anos e dois meses de prisão. Em 2017, tentou fugir da cadeia. Acabou levando um tiro na barriga.
Luís Fernando Ribeiro (Fernandinho): Apontado como o financiador do plano e um dos líderes do esquema. Foi sequestrado e morto em 2005, na cidade de Camanducaia, Minas Gerais, mesmo após a família pagar R$ 2 milhões pelo resgate.
Moisés Teixeira da Silva (Tatuzão): Considerado o escavador do bando, dado o apelido. Foi preso após uma ação da PF em uma padaria. Condenado a 17 anos de prisão, teve a pena reduzida para 2 anos. Atualmente, está livre.
Marcos Rogério Machado de Morais (Cabeçudo): Engenheiro do túnel. Foi preso em agosto de 2007. Em 2011, fugiu da cadeia. Continua foragido.
José Charles Machado de Morais: Irmão de Marcos Rogério, dono da transportadora que ancorou as investigações. Preso em 2005 por lavagem de dinheiro e formação de quadrilha. Condenado a 36 anos de prisão, teve a pena reduzida para 18.
Jorge Luiz da Silva: Abriu uma empresa de fachada para encobrir a escavação do túnel. Foi preso em setembro de 2008.
Deucimar Neves Queiroz: Ex-segurança do Banco Central de Fortaleza, forneceu informações privilegiadas para os criminosos. Ficou com 2 milhões do montante roubado. Foi preso em 2006.
Surpreendentemente, no dia do lançamento de 3 Tonelada$: Assalto ao Banco Central, a PF prendeu Francisca Eliziana Fernandes da Silva, suspeita de lavar o dinheiro roubado no esquema.